Выпускающие подразделения
Институт космических технологий
- Департамент механики и мехатроники
- Департамент инженерного бизнеса и менеджмента
- Базовая кафедра «Специальные материалы и электромеханические конструкции» в АО «Корпорация «ВНИИЭМ»
- Базовая кафедра «Технологический менеджмент» в ФГУП «НПО «Техномаш»
Департамент машиностроения и приборостроения
Департамент недропользования и нефтегазового дела
Кафедра иностранных языков Инженерной академии
Кафедра русского языка Инженерной академии
Научные центры
- Научный центр космической робототехники, нанотехнологий и управления полетом космических аппаратов
- Научный центр компьютерного моделирования инженерных конструкций и сложных систем
- Научный центр разработки геоинформационных технологий
Учебные центры
- Центр управления полетами
- Центр дистанционного зондирования Земли
- Международный маркетинговый центр
Центр дополнительного образования
Центр дополнительного образования Инженерной академии осуществляет подготовку по направлениям: инженерные науки, дизайн, экономика, менеджмент. В форматах обучения летних/зимних школ, повышения квалификации с отрывом и без отрыва от производства (вечернее время).